曾英削提督衔，贬为顺庆总兵，其部下于大海、李茂春也因诬陷反坐，贬为副将，文安之还趁机调整曾英兵马，给他编额战兵三千，辅兵一千零八十, 镇守顺庆一府。
四川总督王应熊也被文安之记过一次，其督标也被削为三千，原提督王祥同样贬为总兵，而且是督标总兵，统领四川总督的三千标营，其部驻防播州。
这位原是王应熊家仆的猛将，十几岁时就能扛起几百斤的石墩子, 能舞起百多斤大刀, 号称小霸王，他年轻时被王应熊送去考了武生，后在四川为军，屡立战功，十分勇悍有名，王应熊当初能保遵义不失，就全凭这个旧仆。
弘光时曾授王祥挂征讨将军印，王祥勇悍，但也十分跋扈，完全把遵义当成私人地盘，之前就不怎么听经略之令。
这次文安之也是不客气的把他由提督降为总兵，还是王应熊的标兵，等于两人才剩下三千战兵兵额。
要知道，这王祥之前在遵义那就是个军阀，他到处招兵买马，甚至招募那些贼匪等，连摇黄贼土暴子都去招揽，他还给招来的这些贼匪、军头等授总兵、挂印, 麾下号称三十六挂印总兵官。
挂印总兵在早前, 那是只有公侯伯们才能担任的重臣大将，虽说明末时不值钱了，但那也是顶级武将名衔，结果王祥自己原是弘光朝的挂印总兵，现在自己私下任命了三十六个总兵，还俱挂印。
这事文安之当然知道，也屡次让他改过，但没当回事。
这次文安之直接就把王祥贬为总督标营总兵，他麾下的那些乱七八糟三十六挂印总兵，被文安之全部罢撤，要求解散归农。
紧接着，文安之也把樊一蘅斥责，记过，并将其督标削为三千，其麾下倚重的大将甘良臣贬去提督衔，降为督标总兵。侯天锡、屠龙、马应试，皆贬为副将。
忠勇镇总兵官秦翼明升四川提督，游击马万春升提标参将，兵额三千，驻宜宾。
原石柱总兵马万年改为忠勇镇总兵，兵额三千，驻石柱。
松潘副将朱化龙升为松潘总兵，兵额三千，驻松潘。
原云南提督杨展，调为统领五省经略提标营五千人马，驻奉节。
原忠孝军的曹勋升建昌镇总兵官，兵三千，驻建昌。
四川巡按御史兼五省监军御史张岱被文安之授为四川巡抚。
李乾德为云南巡抚。
范文光仍为贵州总督。
·······
原来川中有几大主要势力，分别是总督王应熊和王祥，他们驻遵义。
然后是巡抚马乾和总兵曾英、于大海、李茂春等，他们在川东一带。
还有总督樊一蘅，以及总兵甘良甘，副将侯天锡、屠龙、马应试等，另外还有如范文光、曹勋、杨展、谭弘谭诣谭文等部明军。
上次的整编，各部都没有怎么遵守，如王祥甚至公然私自任命了三十六挂印总兵等。