将新占据领地的领民迁移走以及调整了常备番队的驻地后，政良紧接着下达了拆除部分城砦以及海禁的命令。
拆除城砦方面，与将战争区域的领民迁移走的目的一样，主要是考虑到领地保密需要以及最大限度防止敌对势力派遣奸细混入领地的目的，同时也避免由于领地内出现反抗者据城抵抗的情况，更加是避免需要派遣人手进行守卫。此次需要逐步拆除的分别有南肥前的日之江城（另称为日野江城）、安德城、宇木城；肥后天草郡的大津浦城以及本渡城。
海禁方面。同样是处于领地保密以及守护领地的需要而实施的。目前罗氏家可以开放给领民捕鱼的主要地方分别有伊万里湾、橘湾、大村湾以及有明海，而唐津湾、玄界滩、平户沿海、长崎沿海、天草滩、岛原湾、八代海罗氏家占据海域都是禁止捕鱼的。这些实施海禁的水域，只允许罗氏家水军船只的存在或者是得到政良亲自授命的其余船只的存在。其余渔船以及商船一旦出现，将遭受到罗氏家水军的盘查攻击。
当然，为了增加收入，罗氏家已经将肥前的平户岛设置为了自由贸易岛，任何船只在遵守岛上的法度的情况下，将可以停靠在该岛上，并且进行不收取税费的交易。罗氏家除了参与岛上的交易外，还会对停靠在岛上的船只收取一定的停靠费用。该岛的秩序是由第二常备水军番队以及一部分临时在肥前松浦郡雇佣的农兵来维护的。
此外，在彻底掌控天草郡后，政良还准备开放天草岛上久玉城所把守着的海上关卡。收取一定的过境费。久玉城与对面的萨摩长岛的长岛城隔着一个海湾。长岛与天草岛在西面形成了一个较为广阔的海峡。而长岛屿萨摩出水郡的陆地也同样形成了一处较为狭窄的海峡。
平时肥后豪族的商船出海时。都是分别从这两处海峡，经由八代海进入天草滩，继而出海的。靠近天草岛这一侧的海峡，由于更靠近久玉城，故而一直被久玉城把控着，以往是天草家重要财政来源之一，现在就成为了罗氏家的财源了。
待这些事情都进入正轨后，政良开始着手报复肥后各豪族此前对罗氏家海域的侵犯的事情了。
其实。报复早就开始了。
当初在大矢野家的帮助下，罗氏家一举夺下田平城，并且将名和、鹿子木以及内空閑三家的水军的主力给一窝端了。
此后，又通过以交换名和行直以及内河宗直的条件，迫使名和家配合罗氏家，以商议要事的名义将大津浦家以及栖本家的家督引诱到了罗氏家准备的鸿门宴中，最终迫使大津浦家以及栖本家屈服投诚，从而组成罗氏家、大津浦家、栖本家以及大矢野家的联合水军，一举设伏击溃了天草家的水军。
至于当时反水的志岐家水军，则是政良用二十五艘荷船将长崎半岛福田城中圆城寺信胤统领的第六常备水军番队秘密运送到了天草岛上。然后一夜之间将志岐家所在的海湾给控制了起来，然后迫使志岐家协助引诱天草家进入伏击圈的。