整个北京城的抵抗很是虚弱，即便是一些忠于大明的文武官员，当看到诸门大开，大批大中军入城之后，也都知道再抵抗下去已经毫无意义，除了多死一些人之外，他们已经不可能保住大明王朝了，于是不少城中的兵将纷纷放下了武器，被大中军解除了武装，迅速的押到了京城之外，看押在了京城外原来的三大营之中。
如此一来，使得肖天健担心的大混乱没有继续在城中持续多久，仅仅是经过了三天时间的清剿之后，大中军便彻底控制住了北京城的局势。
而大中军不同于历史上打下北京城的大顺军，两支军队最根本的区别便是在军纪方面，虽然不可否认，大中军之中也有个别兵将管不住自己，在进入北京城之后，发生了一些抢jie强奸之类的事情，也有一些兵卒小偷小摸顺便偷藏了一些东西，但是整体上大中军的军纪要比起历史上入京的大顺军的那些兵将还是要强出百倍。
所以即便是发生一些不遵军纪的事情，但是规模很小，也多是暗中进行，没有引起更大的骚乱。
更何况肖天健一入城，便立即将军中的宪兵撒到了城中各处对各部大中军兵将进行监管，这些宪兵在卢象升的严令之下，忠实的执行了肖天健的旨意，立即将一批在城中胡来的兵将给抓捕了起来，并且将其单独看押到了一个地方等候处置。
于是在宪兵开始控制城内各处之后，这种本来就很少的混乱也很快被弹压了下去，使得京师没有出现更大规模的混乱局面。
随着一批批城中明军放下武器被押到城外，北京城中的秩序迅速的开始恢复，再加上现在处于戒严期间，任何人不得私自上街，就连一些无家可归的乞丐，也被集中看管了起来，整个京城在大中军入京之后第四天一早，便归于了平静。
肖天健在诸将和诸臣的劝说之下，暂时入住到了紫禁城之中，但是按照他的吩咐，以他目前的情况，根本无需这么大的紫禁城，于是他便将紫禁城之中，仅留下了武英殿作为他暂时的理事之所，其余的宫殿都下旨封闭了起来。
而宫中太监宫女也基本上被遣散完毕，但是由于一些太监和宫女在这个时候，根本无处可去，于是在卢象升的建议之下，肖天健只得暂时留下了这些太监宫女，在宫中负责照料这座紫禁城，今后再抽时间考虑他们的安排之事。
看着刘耀本呈上来的查抄内帑的清单，肖天健不由得叹息了一声，直到看罢了这份清单之后，历史上有关崇祯内帑银数量问题，才算是被肖天健彻底搞清楚了。
虽然肖天健比起历史上李自成入京早了近三年时间，崇祯的内帑消耗没有历史上多，可是在盘点之后肖天健还是发现，崇祯却是不能算是一个吝啬的皇帝，在他的内帑之中，刘耀本率人仅仅抄出了八十万两白银和十七万两黄金，比起后世有人所说，他的内帑之中存银超过三千万两，实在是有着天壤之别，但是比起有人说的仅有十几万两，也要多出一些，对于崇祯这个皇帝来说，这点存货，真算不上太多！毕竟他省着用，还是想要多坚持一段时间，可惜的是他这么省着用，最后剩下的这点黄白之物，还是便宜给了肖天健。