在大中军三路大军攻克北京城之后的两个多月时间里，北方形势飞快的开始变得稳定了下来。
不过虽然肖天健这段时间忙于处理北方的各种政务，却并未对军队放松下来，在北京之战结束之后，京畿一带的局面逐步开始稳定下来之后，为了减少对后勤方面的压力，在肖天健的命令下，原第一镇的左路军，开始撤离京畿，从居庸关返回到宣大，然后逐步回撤到山西境内。
而第二镇刁正所部的中路军，也在结束了北京之战之后不久，开始一部返回辅南一带负责清剿辅南一带残余的官军以及各地的匪患，一部则从沧州进入到山东境内，一方面前往莱州府和登州府接防，并且接过刘泽清麾下的一万多明军降兵，对其进行整编，同时沿山东东部南下，逐步清剿山东东部一带的官军残余势力和地方匪患。
至于右路军辖下的第四镇的兵马，则立即沿运河南下，返回到南直隶一带，复归入石冉麾下，做好下一步南下南方诸省的准备。
而京畿一带到了八月之后，便仅剩下了刘耀本麾下的近卫第二师和三千扩编的羽林卫，充当肖天健的直属兵马，等候下一步的行动，如此一来，便大幅度的减轻了后勤方面的保障压力，使得北上的漕船，可以转运更多的粮食，来缓解北方的粮荒问题。
另外肖天健在拿下北京城之后，斟酌再三，在八月间决定，以宣大、顺天府、永平府以及山海关外的宁远，将这一带的大中军整合起来，成立了一个专门的北方战区，暂时自成一镇，但是以战区这个称呼和其它各镇军进行区别。
也就是说北方战区，可能是临时性的一个编制，今后还可能会被撤销，原因无他，就是尽可能的统一北方长城沿线的大中军在这一带的指挥，一方面负责镇守北京的京畿一带，防备建奴军南下入寇，一方面也防备蒙古人的袭扰，同时积攒力量，做好未来克复辽东以及收复蒙古大草原的准备。
至于北方战区的总都统，肖天健交给了罗立，但是却将李凌风从第一镇军调整到了北方战区，充当罗立的副手。
北方战区的兵力构成方面，除了李凌风麾下原第一镇军驻防在宣大的两个师之外，另外还有罗立麾下驻防在宁远一带的超编近卫第一师，同时还将肖天健入京之前，下旨组建的近卫第三师以及吴襄麾下的山海关官军旧部，全部纳入到北方战区统一归罗立和李凌风调度。
而近卫第三师，在肖天健下旨之后，李信立即便调派得力人手开始着手组建了起来，并且在短短两个月的时间里，就完成了征兵和组建工作，以大中军五五编制的老习惯，新编近卫第三师下辖五个满编战兵营（步兵营），同时按照肖天健的旨意，又为其编入了一个两千人规模的加强骑兵营，另外加上一个师属重炮营和一个满编辎重营以及一个工兵营，使得新编近卫第三师的兵力达到了一万人左右的规模。
而这些新兵兵员的来源，则以顺天府以及永平府等地的当地民众为主，却并没有收编多少投降的三大营的官兵，原因无他，这个时候的明军官兵可以说已经是烂透了，虽然降兵之中也不乏一些精壮之士，但是这些人也都早已变成了老兵痞子，身上带了太多的明军之中的旧习，再想改变他们，就相当不容易了，一旦将这些兵痞子编入军中之后，非但不利于提高战斗力，相反还会起到很大的副作用。